茶树多酚氧化酶基因的SNP分析

选取有代表性的40个茶树品种（系）为材料,先采用PCR-SSCP-银染检测技术,对供试材料的多酚氧化酶（PPO）基因进行SSCP分析,对PPO基因作初步基因分型;根据分型分析结果,对每一类型选择典型品种的PPO基因作进一步的DNA序列分析,用DNASTAR Program 进行单核苷酸多态性（SNP）搜寻.结果表明,茶树PPO基因存在丰富的SNP,其类型包括：转换（A←→G,C←→T）、颠换（A←→T,G←→C,G→T,A→C）与杂合子（C/T,A/G,G/T,A/T,A/C,G/C）.在发现的37个SNPs中,有13个SNPs发生在核酸内切酶酶切位点,有10个错义SNPs位点导致氨基酸的改变.在PPO基因的保守序列区,出现SNP的频率较低.

完成机构：[1]湖南农业大学,茶学教育部重点实验室,湖南长沙410128 [2]广东省农业科学院,茶叶研究所,广东英德513042